暹罗斗鱼淡黄色和蓝色,泰国暹罗斗鱼为什么不能单养
暹罗是风靡世界的小型观赏鱼,1000年前左右被人类驯养。
长期以来,暹罗斗鱼因其多种多样的体色、体型而备受关注。
南昌大学生命科学学院洪一江教授团队主要围绕暹罗斗鱼展开研究,开展群体遗传学和全基因组相关分析,极大地揭示了暹罗斗鱼复杂的驯养历史和表现型多样性的遗传基础。
最近,相关研究论文在刊物《科学进展》上发表。
构建高质量染色体水平基因组
作为一种小型观赏鱼,暹罗斗鱼具有许多表型性状。
什么类型的分子突变,作用于哪些基因使暹罗鱼形成这些表型性状? 这个过程的分子调控机制是什么?
研究决定暹罗斗鱼表现型的基因,首先需要高质量的参考基因组。
研究小组是如何测序斗鱼的基因的?
据悉,洪一江及其团队采用多种测序策略和辅助组装工作,构建了暹罗斗鱼高质量染色体水平基因组,最终组装的基因组大小达到451.29Mb。
获得暹罗斗鱼高质量参考基因组后,团队青年教师张万昌与泰国研究人员合作,收集了700多只表达不同表现型的个体,提取出每条鱼的DNA,利用Illumina平台进行测序工作,对每个个体进行大量测序
这些测序结果均定位于暹罗斗鱼的参考基因组,通过检测700多个个体,共获得约2000万个变异位点。
为筛选相关靶向药物提供良好的研究模式
“我们的暹罗斗鱼研究为进一步挖掘相关功能基因提供了天然的研究模型,在遗传学、基因组学、发育生物学、神经生物学等领域具有一定的价值。
洪一江说:“暹罗斗鱼在历史上经过多年驯化和选育,已经形成了许多种类的表型变异。
“暹罗斗鱼品种丰富多样,为研究脊椎动物形态学发生提供了天然研究材料。
暹粒的基因组大小在各种常见物种中较小,约为斑马鱼的1/4,小鼠的1/7。
由于暹罗的小基因组,暹罗成为了理想的研究物种。
相对于其他研究物种,遗传学研究和分子克隆的相关成本比较低。
此外,暹罗斗鱼最明显的特点是善于战斗。
暹罗鱼之战通常包括前期要挟、互相靠拢、奋力作战、输方逃跑等具体过程。
由于战役的复杂性,对战役这一行为的研究涉及遗传学、神经生物学、内分泌学、组织生理学等多个学科的复杂性状。
“从我们的初步研究结果来看,在专门用于战斗的斗技鱼中,与神经系统控制相关的基因被强烈选择。
洪一江说:“在老鼠和人类的研究中还发现,选定的部分基因与精神分裂症、双向性格障碍、易怒等精神病密切相关。
这为将来研究这些疾病,进一步筛选相关靶向药物提供了很好的研究模式。
魏依晨
资料来源:科技日报